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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
广西百色—粤港澳大湾区首条集装箱班轮航线开通******
中新网百色1月6日电(记者 杨陈)1月6日，满载着铝锭集装箱的“兴桂1091”船舶从广西百色港头塘作业区缓缓驶出，百色港头塘作业区开港，百色—粤港澳大湾区集装箱班轮航线正式开通。
百色地处西部陆海新通道核心节点。百色港作为中国内河地区性重要港口之一，是西南水运出海南线通道和打造西江“亿吨黄金水道”的重要组成部分。
图为集装箱在百色港头塘作业区吊装上船。 龙启柏 摄百色市人民政府副市长李玉成介绍，目前当地已专门修编了百色港总体规划，争取国家和自治区同意右江航道按Ⅲ级以上纳入国家和自治区水运航道规划，专门出台支持粤港澳大湾区集装箱班轮航线的补贴政策。未来，随着百色水利枢纽通航设施工程、黄桶百色铁路与平陆运河同步建成，右江黄金水道将成为川滇黔货物通湾区、出大海的最便捷通道。
当天开港的头塘作业区是百色港的重要港口之一，项目分两个阶段建设，使用岸线1000米，建设规模为10个1000吨级泊位，设计年通过能力270万吨，概算总投资约5.6亿元(人民币，下同)。目前已完成第一阶段建设，建成9#、10#泊位，可实现年吞吐量100万吨，投入资金2.97亿元。
广西百色西江投资发展有限公司董事长班玉满介绍，与常规的汽运价格相比，开展集装箱运输后，从百色到珠三角地区的物流价格每吨可减少30元，大大降低腹地企业进出口运输成本。在珠江—西江经济带推动集装箱运输常态化、班轮化和集约化，将形成一条“绿色、畅通、便捷、高效”的水上运输通道。
图为百色—粤港澳大湾区集装箱班轮航线启航。 龙启柏 摄百色是广西重要的工业地市，铝产业是广西千亿元支柱产业之一，当地生产的大量铝产品均销往粤港澳大湾区。
广西桂科院铝业有限公司总经理陈治武告诉记者，百色-粤港澳大湾区集装箱班轮航线的开通，有利于该企业最大化承接云南、贵州、广西等三省区向内陆输送铝资源，有效平衡铝产品的运输效率和运输成本问题。通过规模化发展和引导返程货源，还可以大幅降低综合物流成本。
据悉，百色—粤港澳大湾区集装箱班轮航线开通以及接下来的天天班运营，也是构建全新的港口供应链生态圈的重要举措，它将发货人、航运公司、物流公司、港口码头、收货人、第三方监管、金融等主体有效结合，促进门到门、端到端货物流通模式的发展，形成物流、信息流、资金流、商流相辅相成的生态圈。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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